对于动物细胞/组织,可使用ImmunoWay专用动物细胞和组织总蛋白提取试剂盒(RS0024)进行总蛋白提取(操作步骤详见产品说明书)。
或使用RIPA细胞裂解液、NP-40裂解液、SDS裂解液裂解细胞或组织,需加入蛋白酶抑制剂。
若是磷酸化蛋白检测,还需加入磷酸酶抑制剂,避免磷酸化形式的蛋白发生去磷酸化;类似的,检测乙酰化蛋白的时候需要加入去乙酰化酶抑制剂
不同裂解液的区别:NP-40裂解液以非离子型去污剂NP-40(或Triton X-100)为主要成分,通常还包含Tris-HCl缓冲液和150 mM NaCl,裂解条件温和,能有效释放细胞质蛋白和部分膜结合蛋白,同时较好地保留蛋白的天然构象及蛋白-蛋白相互作用,适用于抗体识别非变性表位或需维持复合物结构的实验。相比之下,RIPA裂解液成分更强,除含NP-40或Triton X-100外,还添加了离子型去污剂脱氧胆酸钠和低浓度SDS(通常0.1%),使其具备更强的裂解能力,可高效提取全细胞蛋白、核蛋白、膜蛋白及难溶性蛋白,但会完全变性目标蛋白并破坏蛋白复合物,因此不适用于需要保持天然结构的检测。总体而言,若目标蛋白为常规胞内或膜蛋白且抗体识别变性抗原(绝大多数WB抗体属于此类),RIPA是首选;若关注蛋白天然状态、弱相互作用或抗体明确要求非变性条件,则应选用NP-40等温和裂解液。
根据细胞类型进行如下操作:
(1)细胞收集与裂解
贴壁细胞 | 1. 将培养皿置于冰上并用预冷的PBS清洗2次。 2. 将PBS吸干,加入适量预冷的细胞裂解液裂解细胞(1mL裂解液-约107个细胞,供参考,可根据实际情况调整) 。 3. 用预冷的细胞铲刮下细胞,并用移液枪吸取刮下的细胞裂解液,转移至预冷的离心管中。 |
悬浮细胞 | 1.通过离心收集悬浮细胞。 2.用1×预冷PBS重悬清洗细胞,1000rpm,离心2分钟,弃上清,重复清洗步骤一次,以去除培养液中的血清和杂质,收集细胞沉淀。 3.手指轻敲沉淀,使其松散,按照约每1×107个细胞加入1mL RIPA细胞裂解液,弹匀沉淀,置于冰上。 |
组织样本 | 1.在预冷的培养皿上将组织剪切成细小的组织块 2. 用液氮速冻组织或在-80℃冰箱冷冻组织半小时 3. 加入液氮充分研磨组织,研磨时长尽量控制在2min内,减少蛋白降解 4. 收集组织碎末至离心管中,按照20mg组织加入150-250μL裂解液(供参考,可根据实际情况调整),弹匀沉淀,置于冰上 (对于富含血液的组织,尤其要洗净血液。防止后续因内源IgG产生干扰,可用PBS或生理盐水(加PMSF)洗涤2-3次去除组织中的血液,采集好的组织样品可立即进行后续处理,也可先低温冷冻保存。) |
在涡旋震荡仪涡旋10s后置于冰上裂解5min,重复此步骤4次(或使用超声波破碎仪超声样本,样本超声前需弹匀沉淀,轻微离心,超声4-5s/次,每次间隔5s,超声3min,具体时间根据实际情况调整),裂解至样本为均一不粘稠的液体即可,12000rpm,4°C离心10min,吸取上清(蛋白提取液)至另一洁净离心管中。
如果制备的样品中含有大量的核酸或脂类,则有可能影响蛋白的电泳速率或形成大的复合物而不能进入浓缩胶,核酸通常可以通过超声处理或者使用1mL带针头注射器反复抽吸的方法打断成小片段,在制备脂肪组织样品时,制样后低温离心或低温放置,使脂肪固化,分离油脂,吸取中间层,从而减少脂类的干扰
部分研究人员会采用1×SDS PAGE loading buffer直接裂解细胞(在通风橱操作),这样操作的优点是快速便捷,缺点是后续不方便测定蛋白浓度以校准每个点样孔的总蛋白量。
(2)预留少量蛋白裂解液用于蛋白浓度测定,以确保上样量稳定可控,可使用BCA蛋白定量试剂盒进行蛋白浓度测定(操作步骤详见试剂盒说明书)。
(3)蛋白变性: 向剩余的蛋白提取液中加入对应体积的5×SDS PAGE loading buffer(RS0015),充分混匀后,使用95℃金属浴加热5-10 min,12000 rpm离心2 min,常温下置于EP管架用于跑胶点样。剩余样品也可保存于-80℃冰箱(从冰箱拿出使用时需37℃金属浴3-5 min解冻)。
5×loading buffer的主要成分是SDS(十二烷基硫酸钠)、β-巯基乙醇、甘油、溴酚蓝。SDS是一种阴离子表面激活剂,能使蛋白质的氢键、疏水键打开并结合到蛋白质分子上,形成蛋白质-SDS 复合物。由于十二烷基硫酸根带负电,使各种蛋白质的 SDS-复合物都带上大量负电荷,从而屏蔽不同种类蛋白质的电荷差别。SDS与蛋白质结合后,还会引起蛋白质构象改变。使它们在水溶液中的形状近似长椭圆棒状,不同蛋白质与SDS 复合物的短轴长度都一样,约为1.8nm,而长轴则与蛋白质的相对分子质量成正比。因此蛋白质-SDS复合物在凝胶电泳中的迁移率不再受蛋白质原有电荷和形状的影响,而只与椭圆棒的长度,也就是蛋白质的相对分子质量相关。巯基乙醇能使蛋白质分子中的二硫键还原。甘油可以加大样品密度,使样品沉降到点样孔中。溴酚蓝用来指示蛋白的大概位置。通过加热促使蛋白质完全变性。