免疫学实验专题

Western Blot 实验流程深度解析

2025-11-11

Western Blot 实验流程深度解析


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蛋白质免疫印迹(Western Blot,简称 WB)是一种广泛应用于分子生物学、生物化学和细胞生物学领域的实验技术,通过免疫学方法检测复杂样品(如细胞或组织裂解液)中目标蛋白的表达情况。

Method


基 本 原 理


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Western blot(蛋白质免疫印迹)的原理主要包括:

1. 通过SDS-PAGE凝胶电泳分离蛋白质

SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)是Western blot实验中用于分离蛋白质的关键步骤。
SDS是一种阴离子去垢剂,能够破坏蛋白质的高级结构(包括二级、三级和四级结构),使其完全变性并线性化;SDS以约每两个氨基酸残基结合一个SDS分子的比例大量结合到蛋白质多肽链上,赋予所有蛋白质均匀且强烈的负电荷,从而掩盖了不同蛋白质原有的电荷差异(电荷屏蔽作用)。使蛋白质在电场中的迁移速率不再受其天然电荷或形状的影响。
聚丙烯酰胺凝胶则作为分子筛介质,使蛋白质在电场中按照分子量大小分离,聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺单体与交联剂N,N'-亚甲基双丙烯酰胺在催化剂作用下聚合形成的三维网状结构,其孔径大小可通过调节丙烯酰胺浓度进行控制:低浓度凝胶(如8%)孔径较大,适合分离高分子量蛋白(>100 kDa),而高浓度凝胶(如15%)孔径较小,更适合分离低分子量蛋白(<30 kDa),梯度胶则可覆盖更宽的分子量范围。
标准的SDS-PAGE凝胶通常采用双层结构,上层为浓缩胶(约4–5%浓度,pH 6.8),其作用是在电泳初期将样品中的蛋白质压缩成一条狭窄的起始带,提高分离分辨率;下层为分离胶(如10%、12%等,pH 8.8),在此区域蛋白质才真正依据分子量大小被分开。
在实验操作中,蛋白样品需先与含有SDS和还原剂(如β-巯基乙醇或DTT)的蛋白上样缓冲液混合,并在95–100°C加热5–10分钟,以确保充分变性和二硫键断裂,随后加载到凝胶孔中,并同时加入蛋白分子量Marker作为参照。电泳过程通常先以较低电压(如80 V)使样品通过浓缩胶,再切换至较高电压(100–120 V)进入分离胶,直至上样缓冲液中的指示染料溴酚蓝迁移到凝胶底部。
这一步骤不仅实现了蛋白质的高分辨率分离,还为后续的转膜和抗体特异性识别奠定了基础,是Western blot能够准确检测目标蛋白存在与否、判断其分子量是否正确以及进行半定量分析的前提条件。

2. 将蛋白质转移到固相膜上(转膜)

由于聚丙烯酰胺凝胶本身结构脆弱、孔隙小且不利于抗体渗透,无法直接用于后续的免疫检测。因此通过电转移,将凝胶中分离的蛋白质“印迹”到一张固相支持膜上,以便于后续抗体结合。
常用的膜包括硝酸纤维素膜(NC膜)和聚偏二氟乙烯膜(PVDF膜),其中NC膜结合蛋白能力强、背景低,但机械强度较差;PVDF膜则更坚韧、耐有机溶剂,且可重复检测,但在使用前需用甲醇活化以增强其亲水性和蛋白结合能力。
转膜通常采用电转移法(electroblotting),将凝胶与膜夹在多层滤纸和导电海绵之间,形成“三明治”结构(阴极–海绵–滤纸–凝胶–膜–滤纸–海绵–阳极),并置于转膜缓冲液中,在恒定电流或电压下施加电场。在电场作用下,带负电的蛋白质从凝胶中向正极方向迁移,并被固相膜捕获而固定在膜表面,同时保持与凝胶中相同的相对位置。
转膜效率受多种因素影响,包括蛋白质分子量(大分子蛋白转移较慢)、转膜时间、电流强度、缓冲液成分(常用含甲醇的Tris-甘氨酸缓冲液,甲醇有助于蛋白与膜结合并防止凝胶过度膨胀)以及温度(通常需在冰浴中进行以避免过热导致蛋白降解或凝胶熔化)。转膜完成后,可通过丽春红S染色或预染蛋白Marker的可见条带初步验证转移是否成功。


3. 用特异性抗体检测目标蛋白(免疫识别)

这一步依赖于特异性的抗体来“识别”并结合膜上固定的目标蛋白。首先需对膜进行封闭(blocking),用5%脱脂奶粉或牛血清白蛋白(BSA)溶液在室温下孵育1小时,以占据膜上未结合蛋白的空余位点,从而减少后续抗体的非特异性结合和背景信号。
封闭后,加入针对目标蛋白的一抗(primary antibody),该抗体由宿主动物(如兔、鼠)免疫产生,能特异性识别目标蛋白上的特定抗原表位。一抗通常用封闭液稀释至适当浓度,并在4°C孵育过夜或室温孵育1–2小时,以确保充分结合。随后用洗涤缓冲液(如TBST)多次漂洗膜,去除未结合的一抗。接着加入酶标记的二抗(secondary antibody),该二抗能特异性识别一抗的种属来源,并偶联有报告酶(最常用的是辣根过氧化物酶,HRP)。二抗同样用封闭液稀释,在室温孵育约1小时后,再次充分洗涤以去除非特异性结合的二抗。最后,加入相应的底物进行信号检测:若使用HRP标记的二抗,则加入化学发光底物ECL试剂,HRP催化底物反应产生光信号,通过化学发光成像系统捕获图像。

信号条带的位置对应目标蛋白的分子量,强度则反映其相对表达水平。为确保结果可靠性,通常还需检测内参蛋白(如β-actin、GAPDH或Tubulin),以校正上样量和转膜效率的差异。整个免疫识别过程兼具高特异性和高灵敏度,是Western blot实现目标蛋白定性和半定量分析的核心环节, Western blot是蛋白检测的金标准之一。


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protocol


实验流程

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Western blot的实验流程主要包括:蛋白样本制备-凝胶电泳-转膜-封闭-一、二抗体孵育-显影。


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01

蛋白样本制备



对于动物细胞/组织,可使用ImmunoWay专用动物细胞和组织总蛋白提取试剂盒(RS0024)进行总蛋白提取(操作步骤详见产品说明书)。

或使用RIPA细胞裂解液、NP-40裂解液、SDS裂解液裂解细胞或组织,需加入蛋白酶抑制剂。

若是磷酸化蛋白检测,还需加入磷酸酶抑制剂,避免磷酸化形式的蛋白发生去磷酸化;类似的,检测乙酰化蛋白的时候需要加入去乙酰化酶抑制剂
不同裂解液的区别:NP-40裂解液以非离子型去污剂NP-40(或Triton X-100)为主要成分,通常还包含Tris-HCl缓冲液和150 mM NaCl,裂解条件温和,能有效释放细胞质蛋白和部分膜结合蛋白,同时较好地保留蛋白的天然构象及蛋白-蛋白相互作用,适用于抗体识别非变性表位或需维持复合物结构的实验。相比之下,RIPA裂解液成分更强,除含NP-40或Triton X-100外,还添加了离子型去污剂脱氧胆酸钠和低浓度SDS(通常0.1%),使其具备更强的裂解能力,可高效提取全细胞蛋白、核蛋白、膜蛋白及难溶性蛋白,但会完全变性目标蛋白并破坏蛋白复合物,因此不适用于需要保持天然结构的检测。总体而言,若目标蛋白为常规胞内或膜蛋白且抗体识别变性抗原(绝大多数WB抗体属于此类),RIPA是首选;若关注蛋白天然状态、弱相互作用或抗体明确要求非变性条件,则应选用NP-40等温和裂解液。

根据细胞类型进行如下操作:

(1)细胞收集与裂解

贴壁细胞

1. 将培养皿置于冰上并用预冷的PBS清洗2次。

2. 将PBS吸干,加入适量预冷的细胞裂解液裂解细胞(1mL裂解液-约107个细胞,供参考,可根据实际情况调整) 。

3. 用预冷的细胞铲刮下细胞,并用移液枪吸取刮下的细胞裂解液,转移至预冷的离心管中。

悬浮细胞

1.通过离心收集悬浮细胞。

2.用1×预冷PBS重悬清洗细胞,1000rpm,离心2分钟,弃上清,重复清洗步骤一次,以去除培养液中的血清和杂质,收集细胞沉淀。

3.手指轻敲沉淀,使其松散,按照约每1×107个细胞加入1mL RIPA细胞裂解液,弹匀沉淀,置于冰上。

组织样本

1.在预冷的培养皿上将组织剪切成细小的组织块

2. 用液氮速冻组织或在-80℃冰箱冷冻组织半小时

3. 加入液氮充分研磨组织,研磨时长尽量控制在2min内,减少蛋白降解

4. 收集组织碎末至离心管中,按照20mg组织加入150-250μL裂解液(供参考,可根据实际情况调整),弹匀沉淀,置于冰上

(对于富含血液的组织,尤其要洗净血液。防止后续因内源IgG产生干扰,可用PBS或生理盐水(加PMSF)洗涤2-3次去除组织中的血液,采集好的组织样品可立即进行后续处理,也可先低温冷冻保存。)

在涡旋震荡仪涡旋10s后置于冰上裂解5min,重复此步骤4次(或使用超声波破碎仪超声样本,样本超声前需弹匀沉淀,轻微离心,超声4-5s/次,每次间隔5s,超声3min,具体时间根据实际情况调整),裂解至样本为均一不粘稠的液体即可,12000rpm,4°C离心10min,吸取上清(蛋白提取液)至另一洁净离心管中。

如果制备的样品中含有大量的核酸或脂类,则有可能影响蛋白的电泳速率或形成大的复合物而不能进入浓缩胶,核酸通常可以通过超声处理或者使用1mL带针头注射器反复抽吸的方法打断成小片段,在制备脂肪组织样品时,制样后低温离心或低温放置,使脂肪固化,分离油脂,吸取中间层,从而减少脂类的干扰

部分研究人员会采用1×SDS PAGE loading buffer直接裂解细胞(在通风橱操作),这样操作的优点是快速便捷,缺点是后续不方便测定蛋白浓度以校准每个点样孔的总蛋白量。

(2)预留少量蛋白裂解液用于蛋白浓度测定,以确保上样量稳定可控,可使用BCA蛋白定量试剂盒进行蛋白浓度测定(操作步骤详见试剂盒说明书)。

(3)蛋白变性: 向剩余的蛋白提取液中加入对应体积的5×SDS PAGE loading buffer(RS0015),充分混匀后,使用95℃金属浴加热5-10 min,12000 rpm离心2 min,常温下置于EP管架用于跑胶点样。剩余样品也可保存于-80℃冰箱(从冰箱拿出使用时需37℃金属浴3-5 min解冻)。

5×loading buffer的主要成分是SDS(十二烷基硫酸钠)、β-巯基乙醇、甘油、溴酚蓝。SDS是一种阴离子表面激活剂,能使蛋白质的氢键、疏水键打开并结合到蛋白质分子上,形成蛋白质-SDS 复合物。由于十二烷基硫酸根带负电,使各种蛋白质的 SDS-复合物都带上大量负电荷,从而屏蔽不同种类蛋白质的电荷差别。SDS与蛋白质结合后,还会引起蛋白质构象改变。使它们在水溶液中的形状近似长椭圆棒状,不同蛋白质与SDS 复合物的短轴长度都一样,约为1.8nm,而长轴则与蛋白质的相对分子质量成正比。因此蛋白质-SDS复合物在凝胶电泳中的迁移率不再受蛋白质原有电荷和形状的影响,而只与椭圆棒的长度,也就是蛋白质的相对分子质量相关。巯基乙醇能使蛋白质分子中的二硫键还原。甘油可以加大样品密度,使样品沉降到点样孔中。溴酚蓝用来指示蛋白的大概位置。通过加热促使蛋白质完全变性。






02

凝胶电泳



(1)玻璃板清洗与组装:一般使用1.5mm/1.0mm厚度的玻璃板和对应的梳子(根据样本量多少和实际情况选择玻璃板厚度和梳子规格),用水充分清洗梳子、胶垫和玻璃板表面,风干或吹风机烤干后按说明书组装好备用。组装时注意玻璃板底端对齐,组装后可适当按压玻璃板,使其与胶垫紧密接触,防止漏胶。

(2)配制SDS-聚丙烯酰胺凝胶:

聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺和交联剂N,N’一亚甲基双丙烯酰胺在催化剂过硫酸铵 (APS),催化加速剂四甲基乙二胺 (TEMED)作用下,聚合交联形成的具有网状立体结构的凝胶,具有分子筛效应,以此作为支持物进行蛋白电泳

先配制下层分离胶,根据所需检测的蛋白分子量决定配胶浓度,分子量越小的蛋白,对应胶浓度越大,分离效果越好(配胶过程需在通风橱内操作)。

最佳分离范围SDS-PAGE分离胶参考浓度

10-40 kDa

15%

12-60 kDa

12%

15-100 kDa

10%

20-200 kDa

8%

200 kDa以上

4-6%

配制下层分离胶,各成分配比如下:

成分各成分所占体积(mL)

分离胶浓度

6%

8%

10%

12%

15%

ddH2O

5.3

4.6

4.0

3.3

2.3

30% 丙烯酰胺

2.0

2.7

3.3

4.0

5.0

1.5M Tris-Hcl(PH8.8)

2.5

2.5

2.5

2.5

2.5

10% SDS

0.1

0.1

0.1

0.1

0.1

10% 过硫酸铵

0.1

0.1

0.1

0.1

0.1

四甲基乙二胺(TEMED)

0.008

0.006

0.004

0.004

0.004

总体积(mL)10

在15 ml离心管中依次加入各组分,颠倒混匀后,迅速倒入组装好的玻璃板中,加液至玻璃板高度的四分之三,加入无水乙醇封住胶面(其作用是消除气泡,使胶面平整)。室温放置,待剩余在15 ml离心管中的胶液凝固后,表明玻璃板中的胶已凝固(约20 min,或通过观察胶溶液与乙醇液体的分界线是否清晰判断胶是否凝固),倒掉玻璃板中的无水乙醇,放置晾干。

配置上层浓缩胶,浓度为5%,各成分配比如下:

成分

各成分所占体积(mL)

浓缩胶浓度

5%

ddH2O

2.1

2.7

4.1

5.5

6.8

30% 丙烯酰胺

0.5

0.67

1.0

1.3

1.7

1.0M Tris-Hcl(PH6.8)

0.38

0.5

0.75

1.0

1.25

10% SDS

0.03

0.04

0.06

0.08

0.1

10% 过硫酸铵

0.03

0.04

0.06

0.08

0.1

四甲基乙二胺

0.003

0.004

0.006

0.008

0.01

总体积(mL)

3

4

6

8

10

在15ml离心管中依次加入各组分,颠倒混匀后,迅速倒入玻璃板中,倒满后,插入梳子,室温放置至凝胶凝固(约20 min)。

(3)组装电泳跑胶仪(电泳跑胶仪详细使用方法请参考说明书):

用ddH2O彻底清洗跑胶仪,按说明书进行组装。

检漏:组装好跑胶仪后加入ddH2O至跑胶仪中部凹槽,静置几分钟,检查液面是否下降,若装置漏液,则重新安装玻璃板夹;若不漏液,则倒掉ddH2O,加入1×Running Buffer,加满凹槽,凹槽外测加液至跑胶仪相应刻度线(2块胶加至二分之一刻度线,4块胶加满凹槽外测)。

(4)上样电泳:向上缓慢拔出梳子,防止梳子左右倾斜导致胶孔倾斜,用200 μL移液枪吹打胶孔,去除胶孔中残留的凝胶,用10 μL移液枪匀速缓慢加入样品和预染蛋白marker,建议总蛋白上样量为30μg/孔(根据蛋白表达量适当调整),设置适宜的电泳参数进行电泳(建议浓缩胶恒压80V电泳,分离胶恒压120V电泳),当溴酚蓝电泳至凝胶底部时,停止电泳。






03

转膜



转膜仪详细使用方法请参考相关说明书,以下为常用的湿转方法:

(1)PVDF膜的活化:(提前在冰上预冷1×转膜buffer,用超纯水清洗转膜槽)裁剪合适大小的0.2 μm PVDF薄膜(对于分子量大于20kDa的蛋白,可以选用孔径为0.45μm的PVDF膜),用甲醇活化膜1-5 s(或使用NC膜,无需活化步骤),放入预冷1×转膜buffer中平衡5-15 min。

注意:用镊子夹取膜时注意夹取膜的边缘,以免破环膜上结合的蛋白

(2)转膜仪的组装:待电泳结束后,采用上面三层滤纸,中间一层膜、一层凝胶,下面三层滤纸的三明治结构,将凝胶转移至转膜夹,用翘板将凝胶从玻璃板中取出,放入预冷1×转膜buffer中洗去残留的Running Buffer,组装时注意排去膜、凝胶和滤纸间的气泡,将组装好的转膜夹放入转膜槽中(注意正负极方向正确)

(3)放入冰盒,加入预冷1×转膜buffer覆盖转膜夹,将整个装置置于冰上,恒流转膜。根据目的蛋白的大小,选择合适的转膜条件:

蛋白分子量(kDa)

建议转膜时间

X≤15

恒流250mA, 30min

15

恒流250mA, 50min

30

恒流250mA, 150min

130

恒流270mA, 180 min

X>180

恒流350mA, 180min,或4℃ 20V转膜过夜



若不确定是否转膜成功,可使用Immunoway丽春红S染色液(RS0021)对转移后的膜进行染色,该过程不影响后续抗体孵育






04

封闭



使用Immunoway快速封闭液(YS0109)或5%脱脂奶粉或5%BSA封闭膜上的非特异性位点。

常用封闭液包括脱脂奶粉、BSA和快速封闭液。脱脂奶粉经济高效,蛋白种类丰富,一些情况下封闭效果更强;BSA成分单一,有利于降低背景;快速封闭液(多为商品化配方)可在5–15分钟内完成封闭。一种封闭液不一定适用于所有蛋白,应根据目标蛋白和实验需求选择合适的封闭液。

5%脱脂奶粉或5%BSA溶液配制(50mL):称取2.5g脱脂奶粉或BSA粉末溶解于TBST溶液,定容至50ml离心管刻度线,待转膜结束后,将整张膜浸泡在封闭液中,在摇床上30 rpm,孵育1h(也可4℃封闭过夜,将膜含蛋白一侧朝下放置),封闭结束后将膜转移至1×TBST Buffer中稍微清洗一下,随后用于抗体孵育。






05

抗体孵育



(1)抗体稀释:仔细阅读抗体说明书,选择合适的抗体稀释比例,用封闭液或TBST溶液稀释抗体。

(2)可采用湿盒孵育抗体

对于无偶联的一抗:
4℃孵育一抗过夜(或室温孵育2h),用1×TBST buffer在摇床上洗涤,45rpm,室温摇动5 min,重复洗涤膜3次,洗去未结合的一抗。

② 用擦手纸吸去膜上残留的TBST,用湿盒室温孵育二抗1h(确定二抗的物种反应性需与一抗的宿主相同)。用1×TBST buffer在摇床上洗涤,45rpm,室温摇动5 min,重复洗涤膜3次,去掉未结合的二抗,

对于偶联HRP的一抗:用1×TBST buffer在摇床上洗涤,45rpm,室温摇动5 min,重复洗涤膜3次后直接显影






06

显影



(1)显色液配制:将等体积的显色液A和显色液B混合均匀,推荐用量为10cm2的膜使用1-2mL的显色混合液。

(2)反应与显影:用镊子将膜从1×TBST buffer中夹出,将膜的边角轻触吸水纸,去除膜上多余的液体后,置于一次性EP手套或洁净的显影板上,用移液枪吸取显色混合液均匀覆盖膜,避光反应1min后,用成像分析系统进行显影。

若蛋白样本比较珍贵,可使用Immunoway抗体洗脱液(RS0022)回收利用蛋白膜。





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感 悟
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Western Blot(蛋白质免疫印迹)作为蛋白水平检测的经典技术,其严谨的实验流程体现了分子生物学研究中对精确性与可重复性的基本要求。从样本制备、电泳分离、转膜到免疫检测,每一步均需严格控制实验条件,包括蛋白提取时蛋白酶与磷酸酶抑制剂的合理使用、凝胶浓度与电泳参数的优化、转膜效率的保障,以及一抗特异性与二抗信号系统的匹配。任何环节的疏漏均可能导致结果偏差甚至假阴性。正因如此,Western Blot不仅是一种检测手段,更是科研工作者对实验规范性、数据可靠性及科学逻辑性的综合体现。在后基因组时代,尽管高通量技术不断发展,Western Blot因其直观、特异和半定量的优势,仍在验证蛋白表达与翻译后修饰等研究中具有不可替代的地位。

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名称

货号

1

Total Protein Extraction Kit

RS0024

2

Protein SDS PAGE Loading Buffered Solution, 5X

RS0015

3

Multi-color Prestained Protein Marker(10-180KDa)

D02250

4

Multi-color Prestained Protein Marker(10-250KDa)

D03250

5

Rapid Blocking Buffer (1X, premixed powder) 100mL

YS0109

6

Stripping Buffered Solution for Western Blots

RS0022

7

Goat Anti Mouse IgG(H+L) (HRP)

RS0001

7

Goat Anti Rabbit IgG(H+L) (HRP)

RS0002

8

超敏型ECL化学发光液

YS0123

9

增强型ECL化学发光液

YS0122

10

Antibody dilution

YS0130


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